Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCMTD1Q96MG8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCMTD1Q96MG8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCMTD1Q96MG8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCMTD1Q96MG8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCMTD1Q96MG8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCMTD1Q96MG8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCMTD1Q96MG8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCMTD1Q96MG8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms