Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CFAP36Q96G28 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP36Q96G28 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP36Q96G28 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP36Q96G28 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFAP36Q96G28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP36Q96G28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP36Q96G28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP36Q96G28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms