Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPDL1Q96EA4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPDL1Q96EA4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPDL1Q96EA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPDL1Q96EA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPDL1Q96EA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPDL1Q96EA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPDL1Q96EA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms