Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPSB1Q96BD6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPSB1Q96BD6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB1Q96BD6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB1Q96BD6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB1Q96BD6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB1Q96BD6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB1Q96BD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms