Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RORBQ92753 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RORBQ92753 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RORBQ92753 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RORBQ92753 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RORBQ92753 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RORBQ92753 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RORBQ92753 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RORBQ92753 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RORBQ92753 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RORBQ92753 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RORBQ92753 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RORBQ92753 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RORBQ92753 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RORBQ92753 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RORBQ92753 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RORBQ92753 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RORBQ92753 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RORBQ92753 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RORBQ92753 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RORBQ92753 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORBQ92753 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORBQ92753 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORBQ92753 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RORBQ92753 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RORBQ92753 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RORBQ92753 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RORBQ92753 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RORBQ92753 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RORBQ92753 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORBQ92753 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORBQ92753 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORBQ92753 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORBQ92753 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORBQ92753 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORBQ92753 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORBQ92753 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORBQ92753 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORBQ92753 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORBQ92753 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORBQ92753 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORBQ92753 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORBQ92753 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORBQ92753 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RORBQ92753 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORBQ92753 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORBQ92753 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORBQ92753 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORBQ92753 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORBQ92753 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORBQ92753 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORBQ92753 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORBQ92753 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORBQ92753 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORBQ92753 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORBQ92753 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORBQ92753 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORBQ92753 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORBQ92753 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORBQ92753 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORBQ92753 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORBQ92753 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORBQ92753 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORBQ92753 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORBQ92753 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RORBQ92753 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RORBQ92753 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RORBQ92753 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORBQ92753 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORBQ92753 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORBQ92753 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RORBQ92753 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORBQ92753 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORBQ92753 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORBQ92753 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORBQ92753 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORBQ92753 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORBQ92753 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORBQ92753 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORBQ92753 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORBQ92753 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RORBQ92753 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RORBQ92753 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORBQ92753 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORBQ92753 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORBQ92753 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORBQ92753 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RORBQ92753 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RORBQ92753 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RORBQ92753 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms