Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WHAMMQ8TF30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WHAMMQ8TF30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WHAMMQ8TF30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WHAMMQ8TF30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WHAMMQ8TF30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WHAMMQ8TF30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms