Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC9Q8N567 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC9Q8N567 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC9Q8N567 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ZCCHC9Q8N567 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZCCHC9Q8N567 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC9Q8N567 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms