Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms