Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00596Q86U02 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00596Q86U02 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00596Q86U02 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00596Q86U02 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00596Q86U02 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00596Q86U02 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00596Q86U02 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00596Q86U02 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00596Q86U02 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00596Q86U02 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00596Q86U02 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00596Q86U02 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00596Q86U02 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms