Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMTOR1Q6IAA8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMTOR1Q6IAA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMTOR1Q6IAA8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMTOR1Q6IAA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMTOR1Q6IAA8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms