Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRED3Q2MJR0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRED3Q2MJR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPRED3Q2MJR0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPRED3Q2MJR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRED3Q2MJR0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPRED3Q2MJR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms