Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTC4SQ16873 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTC4SQ16873 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTC4SQ16873 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTC4SQ16873 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTC4SQ16873 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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