Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms