Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2Q16342 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PDCD2Q16342 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCD2Q16342 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCD2Q16342 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCD2Q16342 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2Q16342 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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