Protein–RNA interactions for Protein: Q15669

RHOH, Rho-related GTP-binding protein RhoH, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOHQ15669 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOHQ15669 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RHOHQ15669 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHOHQ15669 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHOHQ15669 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHOHQ15669 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOHQ15669 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms