Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMS2P11Q13670 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMS2P11Q13670 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMS2P11Q13670 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P11Q13670 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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