Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNASE1L3Q13609 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNASE1L3Q13609 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNASE1L3Q13609 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNASE1L3Q13609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNASE1L3Q13609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNASE1L3Q13609 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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