Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDSRQ06136 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDSRQ06136 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDSRQ06136 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDSRQ06136 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
KDSRQ06136 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDSRQ06136 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDSRQ06136 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDSRQ06136 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDSRQ06136 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDSRQ06136 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDSRQ06136 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDSRQ06136 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDSRQ06136 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDSRQ06136 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDSRQ06136 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDSRQ06136 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDSRQ06136 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDSRQ06136 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
KDSRQ06136 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KDSRQ06136 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDSRQ06136 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDSRQ06136 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDSRQ06136 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms