Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRSF11Q05519 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF11Q05519 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF11Q05519 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF11Q05519 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF11Q05519 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms