Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEFA3P59666 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEFA3P59666 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEFA3P59666 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEFA3P59666 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA3P59666 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEFA3P59666 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEFA3P59666 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms