Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNU13P55769 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNU13P55769 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNU13P55769 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNU13P55769 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNU13P55769 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNU13P55769 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNU13P55769 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNU13P55769 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNU13P55769 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNU13P55769 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNU13P55769 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNU13P55769 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNU13P55769 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNU13P55769 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNU13P55769 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNU13P55769 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNU13P55769 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNU13P55769 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNU13P55769 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNU13P55769 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNU13P55769 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNU13P55769 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNU13P55769 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNU13P55769 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNU13P55769 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNU13P55769 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNU13P55769 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNU13P55769 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNU13P55769 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNU13P55769 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNU13P55769 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNU13P55769 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNU13P55769 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNU13P55769 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNU13P55769 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNU13P55769 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNU13P55769 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNU13P55769 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNU13P55769 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNU13P55769 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNU13P55769 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNU13P55769 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNU13P55769 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNU13P55769 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNU13P55769 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNU13P55769 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNU13P55769 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNU13P55769 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNU13P55769 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNU13P55769 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNU13P55769 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNU13P55769 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNU13P55769 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNU13P55769 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNU13P55769 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNU13P55769 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNU13P55769 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNU13P55769 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNU13P55769 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNU13P55769 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNU13P55769 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNU13P55769 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNU13P55769 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNU13P55769 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNU13P55769 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNU13P55769 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNU13P55769 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNU13P55769 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNU13P55769 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNU13P55769 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNU13P55769 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNU13P55769 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNU13P55769 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNU13P55769 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNU13P55769 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNU13P55769 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNU13P55769 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNU13P55769 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNU13P55769 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNU13P55769 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNU13P55769 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNU13P55769 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNU13P55769 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNU13P55769 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNU13P55769 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNU13P55769 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNU13P55769 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNU13P55769 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNU13P55769 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNU13P55769 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNU13P55769 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNU13P55769 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNU13P55769 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNU13P55769 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms