Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA1P52907 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA1P52907 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPZA1P52907 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA1P52907 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPZA1P52907 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPZA1P52907 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms