Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPZA1P52907 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPZA1P52907 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPZA1P52907 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPZA1P52907 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPZA1P52907 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPZA1P52907 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPZA1P52907 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPZA1P52907 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPZA1P52907 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPZA1P52907 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPZA1P52907 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPZA1P52907 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPZA1P52907 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPZA1P52907 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPZA1P52907 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPZA1P52907 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPZA1P52907 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPZA1P52907 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPZA1P52907 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA1P52907 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA1P52907 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPZA1P52907 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPZA1P52907 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPZA1P52907 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPZA1P52907 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPZA1P52907 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA1P52907 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPZA1P52907 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA1P52907 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA1P52907 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA1P52907 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPZA1P52907 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPZA1P52907 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPZA1P52907 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA1P52907 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPZA1P52907 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPZA1P52907 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPZA1P52907 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPZA1P52907 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPZA1P52907 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA1P52907 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA1P52907 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA1P52907 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPZA1P52907 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA1P52907 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA1P52907 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA1P52907 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA1P52907 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA1P52907 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA1P52907 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPZA1P52907 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPZA1P52907 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPZA1P52907 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPZA1P52907 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPZA1P52907 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA1P52907 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPZA1P52907 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPZA1P52907 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPZA1P52907 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA1P52907 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPZA1P52907 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA1P52907 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA1P52907 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA1P52907 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPZA1P52907 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA1P52907 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPZA1P52907 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA1P52907 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA1P52907 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA1P52907 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA1P52907 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA1P52907 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA1P52907 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA1P52907 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA1P52907 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPZA1P52907 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPZA1P52907 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPZA1P52907 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPZA1P52907 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA1P52907 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms