Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX5P45973 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX5P45973 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX5P45973 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX5P45973 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX5P45973 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX5P45973 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX5P45973 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX5P45973 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX5P45973 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX5P45973 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX5P45973 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX5P45973 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX5P45973 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX5P45973 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX5P45973 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX5P45973 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX5P45973 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX5P45973 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX5P45973 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX5P45973 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX5P45973 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX5P45973 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX5P45973 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX5P45973 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX5P45973 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX5P45973 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX5P45973 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX5P45973 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX5P45973 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX5P45973 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX5P45973 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX5P45973 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX5P45973 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX5P45973 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX5P45973 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX5P45973 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX5P45973 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX5P45973 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX5P45973 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX5P45973 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX5P45973 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX5P45973 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX5P45973 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX5P45973 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX5P45973 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX5P45973 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CBX5P45973 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX5P45973 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX5P45973 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX5P45973 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX5P45973 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX5P45973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX5P45973 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX5P45973 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX5P45973 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX5P45973 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX5P45973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX5P45973 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBX5P45973 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX5P45973 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX5P45973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX5P45973 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX5P45973 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX5P45973 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX5P45973 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX5P45973 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX5P45973 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX5P45973 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX5P45973 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX5P45973 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX5P45973 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX5P45973 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX5P45973 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX5P45973 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX5P45973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX5P45973 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX5P45973 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX5P45973 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms