Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA1P35221 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA1P35221 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA1P35221 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA1P35221 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA1P35221 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA1P35221 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA1P35221 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.5 ms