Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E2P29084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E2P29084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E2P29084 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E2P29084 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2E2P29084 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2E2P29084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2E2P29084 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms