Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPREP23469 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPREP23469 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPREP23469 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPREP23469 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPREP23469 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPREP23469 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPREP23469 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPREP23469 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPREP23469 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPREP23469 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPREP23469 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPREP23469 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPREP23469 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPREP23469 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPREP23469 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPREP23469 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPREP23469 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPREP23469 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPREP23469 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPREP23469 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPREP23469 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPREP23469 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPREP23469 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPREP23469 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPREP23469 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPREP23469 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPREP23469 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPREP23469 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPREP23469 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPREP23469 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPREP23469 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPREP23469 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPREP23469 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPREP23469 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPREP23469 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPREP23469 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPREP23469 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPREP23469 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPREP23469 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPREP23469 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPREP23469 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPREP23469 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPREP23469 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPREP23469 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPREP23469 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPREP23469 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPREP23469 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPREP23469 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPREP23469 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPREP23469 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPREP23469 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPREP23469 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPREP23469 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPREP23469 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPREP23469 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPREP23469 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPREP23469 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPREP23469 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPREP23469 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPREP23469 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPREP23469 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPREP23469 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPREP23469 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPREP23469 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPREP23469 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPREP23469 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPREP23469 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPREP23469 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPREP23469 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPREP23469 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PTPREP23469 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPREP23469 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPREP23469 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPREP23469 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPREP23469 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPREP23469 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPREP23469 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPREP23469 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPREP23469 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPREP23469 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPREP23469 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPREP23469 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPREP23469 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPREP23469 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPREP23469 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPREP23469 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPREP23469 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPREP23469 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPREP23469 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPREP23469 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPREP23469 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPREP23469 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms