Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RLBP1P12271 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RLBP1P12271 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RLBP1P12271 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RLBP1P12271 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RLBP1P12271 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RLBP1P12271 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RLBP1P12271 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RLBP1P12271 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RLBP1P12271 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RLBP1P12271 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RLBP1P12271 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RLBP1P12271 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RLBP1P12271 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RLBP1P12271 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RLBP1P12271 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RLBP1P12271 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RLBP1P12271 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RLBP1P12271 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms