Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRM1P11229 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRM1P11229 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRM1P11229 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRM1P11229 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRM1P11229 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRM1P11229 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRM1P11229 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRM1P11229 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRM1P11229 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRM1P11229 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRM1P11229 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRM1P11229 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRM1P11229 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRM1P11229 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRM1P11229 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRM1P11229 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHRM1P11229 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRM1P11229 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRM1P11229 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRM1P11229 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRM1P11229 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms