Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPBP07988 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPBP07988 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFTPBP07988 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFTPBP07988 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPBP07988 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms