Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKP06307 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKP06307 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKP06307 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKP06307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKP06307 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKP06307 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKP06307 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKP06307 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKP06307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKP06307 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKP06307 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKP06307 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKP06307 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCKP06307 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKP06307 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKP06307 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms