Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPRP00739 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPRP00739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPRP00739 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPRP00739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPRP00739 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPRP00739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPRP00739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPRP00739 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPRP00739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPRP00739 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPRP00739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPRP00739 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPRP00739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPRP00739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPRP00739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPRP00739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPRP00739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPRP00739 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPRP00739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPRP00739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPRP00739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPRP00739 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPRP00739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPRP00739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPRP00739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPRP00739 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPRP00739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPRP00739 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPRP00739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPRP00739 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPRP00739 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPRP00739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPRP00739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPRP00739 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HPRP00739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPRP00739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPRP00739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPRP00739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPRP00739 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPRP00739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPRP00739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPRP00739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPRP00739 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPRP00739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPRP00739 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPRP00739 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPRP00739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPRP00739 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPRP00739 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPRP00739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPRP00739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPRP00739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPRP00739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPRP00739 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPRP00739 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms