Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPRP00739 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HPRP00739 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HPRP00739 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HPRP00739 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HPRP00739 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HPRP00739 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HPRP00739 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HPRP00739 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPRP00739 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HPRP00739 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HPRP00739 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HPRP00739 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HPRP00739 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPRP00739 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPRP00739 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HPRP00739 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPRP00739 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPRP00739 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HPRP00739 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HPRP00739 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPRP00739 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HPRP00739 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HPRP00739 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HPRP00739 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPRP00739 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HPRP00739 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPRP00739 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPRP00739 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPRP00739 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPRP00739 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPRP00739 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPRP00739 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPRP00739 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HPRP00739 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPRP00739 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HPRP00739 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPRP00739 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPRP00739 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPRP00739 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPRP00739 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPRP00739 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPRP00739 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPRP00739 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPRP00739 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPRP00739 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPRP00739 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPRP00739 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPRP00739 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPRP00739 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPRP00739 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPRP00739 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPRP00739 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPRP00739 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPRP00739 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPRP00739 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPRP00739 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPRP00739 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPRP00739 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPRP00739 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPRP00739 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPRP00739 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPRP00739 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HPRP00739 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HPRP00739 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPRP00739 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPRP00739 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPRP00739 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPRP00739 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPRP00739 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPRP00739 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPRP00739 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPRP00739 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPRP00739 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPRP00739 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPRP00739 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPRP00739 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPRP00739 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPRP00739 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPRP00739 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPRP00739 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPRP00739 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPRP00739 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPRP00739 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPRP00739 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPRP00739 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPRP00739 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPRP00739 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPRP00739 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPRP00739 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPRP00739 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPRP00739 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HPRP00739 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPRP00739 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPRP00739 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPRP00739 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPRP00739 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HPRP00739 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPRP00739 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPRP00739 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms