Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMC2O95347 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC2O95347 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC2O95347 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC2O95347 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC2O95347 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC2O95347 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC2O95347 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMC2O95347 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC2O95347 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC2O95347 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMC2O95347 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC2O95347 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC2O95347 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC2O95347 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC2O95347 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC2O95347 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC2O95347 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC2O95347 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC2O95347 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC2O95347 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC2O95347 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMC2O95347 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMC2O95347 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC2O95347 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC2O95347 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC2O95347 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC2O95347 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC2O95347 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC2O95347 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC2O95347 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC2O95347 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC2O95347 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC2O95347 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC2O95347 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC2O95347 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC2O95347 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC2O95347 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC2O95347 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC2O95347 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC2O95347 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC2O95347 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC2O95347 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC2O95347 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC2O95347 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC2O95347 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC2O95347 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC2O95347 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC2O95347 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC2O95347 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC2O95347 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC2O95347 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC2O95347 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC2O95347 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC2O95347 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC2O95347 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC2O95347 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC2O95347 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC2O95347 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC2O95347 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC2O95347 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC2O95347 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC2O95347 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC2O95347 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC2O95347 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC2O95347 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC2O95347 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC2O95347 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC2O95347 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMC2O95347 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC2O95347 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC2O95347 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC2O95347 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC2O95347 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC2O95347 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC2O95347 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC2O95347 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC2O95347 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC2O95347 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC2O95347 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC2O95347 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC2O95347 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC2O95347 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC2O95347 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC2O95347 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC2O95347 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC2O95347 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC2O95347 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC2O95347 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC2O95347 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC2O95347 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC2O95347 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMC2O95347 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC2O95347 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC2O95347 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC2O95347 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC2O95347 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC2O95347 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC2O95347 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC2O95347 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms