Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LETM1O95202 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LETM1O95202 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LETM1O95202 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LETM1O95202 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LETM1O95202 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LETM1O95202 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LETM1O95202 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LETM1O95202 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LETM1O95202 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LETM1O95202 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LETM1O95202 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LETM1O95202 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LETM1O95202 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LETM1O95202 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LETM1O95202 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LETM1O95202 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LETM1O95202 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LETM1O95202 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LETM1O95202 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LETM1O95202 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LETM1O95202 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LETM1O95202 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LETM1O95202 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LETM1O95202 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LETM1O95202 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LETM1O95202 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LETM1O95202 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LETM1O95202 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LETM1O95202 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LETM1O95202 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LETM1O95202 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LETM1O95202 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LETM1O95202 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LETM1O95202 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LETM1O95202 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LETM1O95202 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LETM1O95202 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LETM1O95202 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LETM1O95202 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LETM1O95202 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LETM1O95202 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LETM1O95202 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LETM1O95202 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LETM1O95202 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LETM1O95202 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LETM1O95202 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LETM1O95202 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LETM1O95202 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LETM1O95202 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LETM1O95202 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LETM1O95202 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LETM1O95202 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LETM1O95202 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LETM1O95202 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LETM1O95202 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LETM1O95202 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LETM1O95202 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LETM1O95202 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LETM1O95202 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LETM1O95202 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LETM1O95202 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LETM1O95202 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LETM1O95202 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LETM1O95202 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LETM1O95202 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LETM1O95202 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LETM1O95202 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LETM1O95202 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LETM1O95202 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LETM1O95202 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LETM1O95202 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LETM1O95202 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LETM1O95202 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LETM1O95202 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LETM1O95202 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LETM1O95202 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LETM1O95202 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LETM1O95202 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LETM1O95202 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LETM1O95202 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LETM1O95202 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LETM1O95202 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LETM1O95202 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LETM1O95202 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LETM1O95202 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LETM1O95202 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LETM1O95202 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LETM1O95202 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms