Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL2O95198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL2O95198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL2O95198 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL2O95198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL2O95198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL2O95198 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL2O95198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL2O95198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL2O95198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL2O95198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL2O95198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL2O95198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms