Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEC1O60732 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEC1O60732 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEC1O60732 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEC1O60732 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEC1O60732 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms