Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL41O60662 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL41O60662 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL41O60662 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL41O60662 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL41O60662 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL41O60662 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms