Protein–RNA interactions for Protein: O60566

BUB1B, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUB1BO60566 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BUB1BO60566 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BUB1BO60566 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BUB1BO60566 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BUB1BO60566 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BUB1BO60566 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BUB1BO60566 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BUB1BO60566 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BUB1BO60566 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms