Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DYNC1I1O14576 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DYNC1I1O14576 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1I1O14576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DYNC1I1O14576 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DYNC1I1O14576 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1I1O14576 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1I1O14576 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1I1O14576 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1I1O14576 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1I1O14576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1I1O14576 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms