Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB11E5RHQ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB11E5RHQ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB11E5RHQ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPB11E5RHQ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPB11E5RHQ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPB11E5RHQ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms