Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP69A5D8W1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP69A5D8W1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP69A5D8W1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP69A5D8W1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP69A5D8W1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms