Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
A0A087WWV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
A0A087WWV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
A0A087WWV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
A0A087WWV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
A0A087WWV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
A0A087WWV3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
A0A087WWV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
A0A087WWV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
A0A087WWV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
A0A087WWV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
A0A087WWV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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