Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 GANAB-212ENST00000534419 640 ntTSL 410.15□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CFLAR-222ENST00000474842 1091 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CDK5RAP2-219ENST00000495406 635 ntTSL 29.76□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMD11-210ENST00000584340 559 ntTSL 49.57□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ERMP1-201ENST00000214893 4974 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-226ENST00000638443 2146 ntTSL 58.41□□□□□ -1.065e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEPT8-202ENST00000371478 737 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CACUL1-205ENST00000490610 394 ntTSL 28.08□□□□□ -1.127e-9■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-203ENST00000503123 298 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CDK5RAP2-210ENST00000474262 549 ntTSL 27.89□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-209ENST00000526567 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-216ENST00000533972 452 ntTSL 37.59□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.235e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 37.34□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-220ENST00000513578 545 ntTSL 47.31□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 KDM5C-210ENST00000467093 446 ntTSL 37.08□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TIMM17A-203ENST00000482943 2523 ntTSL 27.04□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.295e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-203ENST00000473035 571 ntTSL 46.42□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 26.29□□□□□ -1.44e-11■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-208ENST00000530008 580 ntTSL 45.9□□□□□ -1.465e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RAB10-202ENST00000462003 584 ntTSL 45.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-213ENST00000531998 840 ntTSL 35.78□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-217ENST00000511892 547 ntTSL 45.26□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.585e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TRIT1-207ENST00000467774 464 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PRPF40A-208ENST00000472760 243 ntTSL 24.76□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-211ENST00000532755 565 ntTSL 44.76□□□□□ -1.655e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SEC61A1-204ENST00000481210 521 ntTSL 54.65□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-11■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SUCO-208ENST00000609685 761 ntTSL 24.51□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 FAM76B-203ENST00000535919 451 ntTSL 34.45□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SQLE-202ENST00000518604 743 ntTSL 24.41□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EDEM3-205ENST00000466606 487 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ECT2-215ENST00000487073 628 ntTSL 33.95□□□□□ -1.785e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-225ENST00000601453 582 ntTSL 33.94□□□□□ -1.785e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.825e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-211ENST00000509206 490 ntTSL 33.6□□□□□ -1.831e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.841e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 TARDBP-220ENST00000618606 584 ntTSL 23.22□□□□□ -1.895e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CAPRIN1-214ENST00000533641 429 ntTSL 42.94□□□□□ -1.945e-10■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 LMAN1-204ENST00000587940 442 ntTSL 22.93□□□□□ -1.941e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 CNOT2-235ENST00000552151 1682 ntTSL 22.85□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 RNF4-219ENST00000513450 416 ntTSL 52.28□□□□□ -2.041e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 DMTF1-236ENST00000583833 171 ntTSL 32.07□□□□□ -2.081e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.464e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 317.8■□□□□ 0.444e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 416.86■□□□□ 0.294e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 416.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 516.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 516.42■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 312.79□□□□□ -0.364e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 212.66□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 DCAF11-218ENST00000559144 1011 ntTSL 212.2□□□□□ -0.464e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 49.03□□□□□ -0.964e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 44.94□□□□□ -1.624e-7■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 VASP-204ENST00000587444 240 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-9■□□□□ 8.2
SF3B4Q15427 PPIL2-209ENST00000485930 149 ntTSL 35.32□□□□□ -1.561e-28■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CLSTN3-208ENST00000538933 583 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SMG5-203ENST00000473643 541 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-8■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 EPB41-209ENST00000462032 752 ntTSL 25.21□□□□□ -1.589e-21■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-18■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC11.45□□□□□ -0.584e-11■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 DXO-211ENST00000487914 1016 ntTSL 516.33■□□□□ 0.26e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.096e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 311.65□□□□□ -0.546e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-206ENST00000466679 741 ntTSL 310.2□□□□□ -0.786e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.976e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.046e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FREM1-209ENST00000497634 701 ntTSL 32.61□□□□□ -1.996e-7■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-214ENST00000488993 1116 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 419.55■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RFWD3-203ENST00000571776 936 ntTSL 216.92■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-208ENST00000541305 564 ntTSL 216.9■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-215ENST00000491859 919 ntTSL 316.8■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 515.46■□□□□ 0.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 USP19-212ENST00000480163 397 ntTSL 313.93□□□□□ -0.184e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-205ENST00000560411 1088 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 212.92□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 3419.4 ms