RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466679.1

FREM1-206, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix 1, humanhuman

TSL 3

Gene FREM1, Length 741 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1-206ENST00000466679 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.19■■■□□ 2.1
FREM1-206ENST00000466679 ABCC9O60706 1549 aa25.79■■□□□ 1.72
FREM1-206ENST00000466679 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.39■■□□□ 1.66
FREM1-206ENST00000466679 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.45■■□□□ 1.5
FREM1-206ENST00000466679 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.36■■□□□ 1.49
FREM1-206ENST00000466679 NACADO15069 1562 aa24.09■■□□□ 1.45
FREM1-206ENST00000466679 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.09■■□□□ 1.45
FREM1-206ENST00000466679 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
FREM1-206ENST00000466679 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.78■■□□□ 1.4
FREM1-206ENST00000466679 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.64■■□□□ 1.37
FREM1-206ENST00000466679 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
FREM1-206ENST00000466679 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
FREM1-206ENST00000466679 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
FREM1-206ENST00000466679 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
FREM1-206ENST00000466679 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.23■■□□□ 1.31
FREM1-206ENST00000466679 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.21■■□□□ 1.31
FREM1-206ENST00000466679 SCRIBQ14160 1630 aa23.21■■□□□ 1.31
FREM1-206ENST00000466679 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FREM1-206ENST00000466679 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.65■■□□□ 1.22
FREM1-206ENST00000466679 ERCC6Q03468 1493 aa22.3■■□□□ 1.16
FREM1-206ENST00000466679 CUX2O14529 1486 aa22.28■■□□□ 1.16
FREM1-206ENST00000466679 NCAPD3P42695 1498 aa22.25■■□□□ 1.15
FREM1-206ENST00000466679 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.15■■□□□ 1.14
FREM1-206ENST00000466679 SMARCA2P51531 1590 aa22.08■■□□□ 1.12
FREM1-206ENST00000466679 NESP48681 1621 aa22.06■■□□□ 1.12
FREM1-206ENST00000466679 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
FREM1-206ENST00000466679 HMGXB3Q12766 1538 aa22.05■■□□□ 1.12
FREM1-206ENST00000466679 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FREM1-206ENST00000466679 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
FREM1-206ENST00000466679 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FREM1-206ENST00000466679 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.79■■□□□ 1.08
FREM1-206ENST00000466679 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.79■■□□□ 1.08
FREM1-206ENST00000466679 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.74■■□□□ 1.07
FREM1-206ENST00000466679 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.73■■□□□ 1.07
FREM1-206ENST00000466679 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.72■■□□□ 1.07
FREM1-206ENST00000466679 TRIM41Q8WV44 630 aa21.63■■□□□ 1.05
FREM1-206ENST00000466679 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.59■■□□□ 1.05
FREM1-206ENST00000466679 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.55■■□□□ 1.04
FREM1-206ENST00000466679 WIZO95785 1651 aa21.47■■□□□ 1.03
FREM1-206ENST00000466679 WDR62O43379 1518 aa21.47■■□□□ 1.03
FREM1-206ENST00000466679 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.41■■□□□ 1.02
FREM1-206ENST00000466679 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.36■■□□□ 1.01
FREM1-206ENST00000466679 OSCARQ8IYS5 282 aa21.28■■□□□ 1
FREM1-206ENST00000466679 CFTRP13569 1480 aa21.26■□□□□ 0.99
FREM1-206ENST00000466679 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
FREM1-206ENST00000466679 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
FREM1-206ENST00000466679 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
FREM1-206ENST00000466679 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 PRDM2Q13029 1718 aa20.99■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 IFT140Q96RY7 1462 aa20.98■□□□□ 0.95
FREM1-206ENST00000466679 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.94■□□□□ 0.94
FREM1-206ENST00000466679 ARHGEF11O15085 1522 aa20.91■□□□□ 0.94
FREM1-206ENST00000466679 TOPBP1Q92547 1522 aa20.91■□□□□ 0.94
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FREM1-206ENST00000466679 CHD1O14646 1710 aa20.75■□□□□ 0.91
FREM1-206ENST00000466679 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
FREM1-206ENST00000466679 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
FREM1-206ENST00000466679 ARAP1Q96P48 1450 aa20.69■□□□□ 0.9
FREM1-206ENST00000466679 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
FREM1-206ENST00000466679 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.64■□□□□ 0.89
FREM1-206ENST00000466679 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
FREM1-206ENST00000466679 SOGA1O94964 1423 aa20.61■□□□□ 0.89
FREM1-206ENST00000466679 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.56■□□□□ 0.88
FREM1-206ENST00000466679 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FREM1-206ENST00000466679 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.52■□□□□ 0.88
FREM1-206ENST00000466679 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.48■□□□□ 0.87
FREM1-206ENST00000466679 SYNJ1O43426 1573 aa20.47■□□□□ 0.87
FREM1-206ENST00000466679 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FREM1-206ENST00000466679 WDR97A6NE52 1622 aa20.45■□□□□ 0.86
FREM1-206ENST00000466679 GRIN2BQ13224 1484 aa20.44■□□□□ 0.86
FREM1-206ENST00000466679 CUX1P39880 1505 aa20.44■□□□□ 0.86
FREM1-206ENST00000466679 SYNJ2O15056 1496 aa20.4■□□□□ 0.86
FREM1-206ENST00000466679 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FREM1-206ENST00000466679 PBRM1Q86U86 1689 aa20.33■□□□□ 0.85
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FREM1-206ENST00000466679 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.24■□□□□ 0.83
FREM1-206ENST00000466679 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.23■□□□□ 0.83
FREM1-206ENST00000466679 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.19■□□□□ 0.82
FREM1-206ENST00000466679 GRIN2AQ12879 1464 aa20.18■□□□□ 0.82
FREM1-206ENST00000466679 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FREM1-206ENST00000466679 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
FREM1-206ENST00000466679 ADAMTS12P58397 1594 aa20.12■□□□□ 0.81
FREM1-206ENST00000466679 CEP170Q5SW79 1584 aa20.12■□□□□ 0.81
FREM1-206ENST00000466679 NUP160Q12769 1436 aa20.09■□□□□ 0.81
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FREM1-206ENST00000466679 SHROOM2Q13796 1616 aa20.02■□□□□ 0.8
FREM1-206ENST00000466679 TOP2BQ02880 1626 aa20.02■□□□□ 0.79
FREM1-206ENST00000466679 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20■□□□□ 0.79
FREM1-206ENST00000466679 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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FREM1-206ENST00000466679 JPH4Q96JJ6 628 aa19.94■□□□□ 0.78
FREM1-206ENST00000466679 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.93■□□□□ 0.78
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