RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245451.8

BMP4-201, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BMP4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-201ENST00000245451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.15■■■■□ 3.7
BMP4-201ENST00000245451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.45■■■□□ 2.95
BMP4-201ENST00000245451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
BMP4-201ENST00000245451 ABCC9O60706 1549 aa31.95■■■□□ 2.71
BMP4-201ENST00000245451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.56■■■□□ 2.64
BMP4-201ENST00000245451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.55■■■□□ 2.64
BMP4-201ENST00000245451 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.34■■■□□ 2.61
BMP4-201ENST00000245451 NACADO15069 1562 aa31.24■■■□□ 2.59
BMP4-201ENST00000245451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.06■■■□□ 2.56
BMP4-201ENST00000245451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.81■■■□□ 2.52
BMP4-201ENST00000245451 SCRIBQ14160 1630 aa30.7■■■□□ 2.5
BMP4-201ENST00000245451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.41■■■□□ 2.46
BMP4-201ENST00000245451 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.15■■■□□ 2.42
BMP4-201ENST00000245451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
BMP4-201ENST00000245451 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.67■■■□□ 2.34
BMP4-201ENST00000245451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
BMP4-201ENST00000245451 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.46■■■□□ 2.31
BMP4-201ENST00000245451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
BMP4-201ENST00000245451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
BMP4-201ENST00000245451 SMARCA4P51532 1647 aa29.41■■■□□ 2.3
BMP4-201ENST00000245451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
BMP4-201ENST00000245451 WIZO95785 1651 aa29.19■■■□□ 2.26
BMP4-201ENST00000245451 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.09■■■□□ 2.25
BMP4-201ENST00000245451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.02■■■□□ 2.24
BMP4-201ENST00000245451 SMARCA2P51531 1590 aa28.99■■■□□ 2.23
BMP4-201ENST00000245451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.92■■■□□ 2.22
BMP4-201ENST00000245451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
BMP4-201ENST00000245451 NCAPD3P42695 1498 aa28.84■■■□□ 2.21
BMP4-201ENST00000245451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
BMP4-201ENST00000245451 HMGXB3Q12766 1538 aa28.78■■■□□ 2.2
BMP4-201ENST00000245451 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.57■■■□□ 2.16
BMP4-201ENST00000245451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.53■■■□□ 2.16
BMP4-201ENST00000245451 CFTRP13569 1480 aa28.1■■■□□ 2.09
BMP4-201ENST00000245451 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.06■■■□□ 2.08
BMP4-201ENST00000245451 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.99■■■□□ 2.07
BMP4-201ENST00000245451 NESP48681 1621 aa27.94■■■□□ 2.06
BMP4-201ENST00000245451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.92■■■□□ 2.06
BMP4-201ENST00000245451 PRDM2Q13029 1718 aa27.9■■■□□ 2.06
BMP4-201ENST00000245451 ABCC8Q09428 1581 aa27.85■■■□□ 2.05
BMP4-201ENST00000245451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.03
BMP4-201ENST00000245451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
BMP4-201ENST00000245451 TRIM41Q8WV44 630 aa27.71■■■□□ 2.03
BMP4-201ENST00000245451 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.7■■■□□ 2.02
BMP4-201ENST00000245451 SYNJ1O43426 1573 aa27.64■■■□□ 2.02
BMP4-201ENST00000245451 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.61■■■□□ 2.01
BMP4-201ENST00000245451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.6■■■□□ 2.01
BMP4-201ENST00000245451 CUX1P39880 1505 aa27.58■■■□□ 2.01
BMP4-201ENST00000245451 TOP2BQ02880 1626 aa27.55■■■□□ 2
BMP4-201ENST00000245451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.53■■■□□ 2
BMP4-201ENST00000245451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
BMP4-201ENST00000245451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.44■■□□□ 1.98
BMP4-201ENST00000245451 ERCC6Q03468 1493 aa27.42■■□□□ 1.98
BMP4-201ENST00000245451 TOPBP1Q92547 1522 aa27.42■■□□□ 1.98
BMP4-201ENST00000245451 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.38■■□□□ 1.97
BMP4-201ENST00000245451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.33■■□□□ 1.97
BMP4-201ENST00000245451 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
BMP4-201ENST00000245451 WDR62O43379 1518 aa27.27■■□□□ 1.96
BMP4-201ENST00000245451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
BMP4-201ENST00000245451 SOGA1O94964 1423 aa27.25■■□□□ 1.95
BMP4-201ENST00000245451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.17■■□□□ 1.94
BMP4-201ENST00000245451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
BMP4-201ENST00000245451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.16■■□□□ 1.94
BMP4-201ENST00000245451 EEA1Q15075 1411 aa27.11■■□□□ 1.93
BMP4-201ENST00000245451 CUX2O14529 1486 aa27.09■■□□□ 1.93
BMP4-201ENST00000245451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.08■■□□□ 1.93
BMP4-201ENST00000245451 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
BMP4-201ENST00000245451 KIF27Q86VH2 1401 aa27.04■■□□□ 1.92
BMP4-201ENST00000245451 WDR97A6NE52 1622 aa27.04■■□□□ 1.92
BMP4-201ENST00000245451 IFT140Q96RY7 1462 aa26.98■■□□□ 1.91
BMP4-201ENST00000245451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.98■■□□□ 1.91
BMP4-201ENST00000245451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
BMP4-201ENST00000245451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.9■■□□□ 1.9
BMP4-201ENST00000245451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.89■■□□□ 1.9
BMP4-201ENST00000245451 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
BMP4-201ENST00000245451 IGF1RP08069 1367 aa26.85■■□□□ 1.89
BMP4-201ENST00000245451 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.85■■□□□ 1.89
BMP4-201ENST00000245451 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 40.1
BMP4-201ENST00000245451 KIF21BO75037 1637 aa26.79■■□□□ 1.88
BMP4-201ENST00000245451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.79■■□□□ 1.88
BMP4-201ENST00000245451 PRXQ9BXM0 1461 aa26.79■■□□□ 1.88
BMP4-201ENST00000245451 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
BMP4-201ENST00000245451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.76■■□□□ 1.87
BMP4-201ENST00000245451 PBRM1Q86U86 1689 aa26.72■■□□□ 1.87
BMP4-201ENST00000245451 GOLGA3Q08378 1498 aa26.72■■□□□ 1.87
BMP4-201ENST00000245451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.72■■□□□ 1.87
BMP4-201ENST00000245451 GRIN2BQ13224 1484 aa26.7■■□□□ 1.86
BMP4-201ENST00000245451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.69■■□□□ 1.86
BMP4-201ENST00000245451 CUL7Q14999 1698 aa26.68■■□□□ 1.86
BMP4-201ENST00000245451 ADAMTS12P58397 1594 aa26.58■■□□□ 1.85
BMP4-201ENST00000245451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
BMP4-201ENST00000245451 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.57■■□□□ 1.84
BMP4-201ENST00000245451 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.56■■□□□ 1.84
BMP4-201ENST00000245451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.55■■□□□ 1.84
BMP4-201ENST00000245451 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
BMP4-201ENST00000245451 SYNJ2O15056 1496 aa26.42■■□□□ 1.82
BMP4-201ENST00000245451 CEP162Q5TB80 1403 aa26.4■■□□□ 1.82
BMP4-201ENST00000245451 GRIN2AQ12879 1464 aa26.38■■□□□ 1.81
BMP4-201ENST00000245451 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
BMP4-201ENST00000245451 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.32■■□□□ 1.8
BMP4-201ENST00000245451 FBLN2P98095 1184 aa26.3■■□□□ 1.8
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