Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGB3Q9Y5G1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGB3Q9Y5G1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB3Q9Y5G1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB3Q9Y5G1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHGB3Q9Y5G1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHGB3Q9Y5G1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms