Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB12Q9Y5F1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB12Q9Y5F1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB12Q9Y5F1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHB12Q9Y5F1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCDHB12Q9Y5F1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCDHB12Q9Y5F1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB12Q9Y5F1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB12Q9Y5F1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB12Q9Y5F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHB12Q9Y5F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms