Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PCDHB12Q9Y5F1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCDHB12Q9Y5F1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCDHB12Q9Y5F1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PCDHB12Q9Y5F1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCDHB12Q9Y5F1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PCDHB12Q9Y5F1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCDHB12Q9Y5F1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCDHB12Q9Y5F1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCDHB12Q9Y5F1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCDHB12Q9Y5F1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCDHB12Q9Y5F1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCDHB12Q9Y5F1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCDHB12Q9Y5F1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PCDHB12Q9Y5F1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCDHB12Q9Y5F1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCDHB12Q9Y5F1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB12Q9Y5F1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCDHB12Q9Y5F1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCDHB12Q9Y5F1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PCDHB12Q9Y5F1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCDHB12Q9Y5F1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDHB12Q9Y5F1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHB12Q9Y5F1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCDHB12Q9Y5F1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHB12Q9Y5F1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHB12Q9Y5F1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHB12Q9Y5F1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHB12Q9Y5F1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCDHB12Q9Y5F1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCDHB12Q9Y5F1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCDHB12Q9Y5F1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCDHB12Q9Y5F1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PCDHB12Q9Y5F1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCDHB12Q9Y5F1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PCDHB12Q9Y5F1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PCDHB12Q9Y5F1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PCDHB12Q9Y5F1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PCDHB12Q9Y5F1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCDHB12Q9Y5F1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCDHB12Q9Y5F1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCDHB12Q9Y5F1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCDHB12Q9Y5F1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHB12Q9Y5F1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCDHB12Q9Y5F1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCDHB12Q9Y5F1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCDHB12Q9Y5F1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PCDHB12Q9Y5F1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCDHB12Q9Y5F1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCDHB12Q9Y5F1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCDHB12Q9Y5F1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCDHB12Q9Y5F1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHB12Q9Y5F1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHB12Q9Y5F1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCDHB12Q9Y5F1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCDHB12Q9Y5F1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCDHB12Q9Y5F1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PCDHB12Q9Y5F1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PCDHB12Q9Y5F1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PCDHB12Q9Y5F1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PCDHB12Q9Y5F1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PCDHB12Q9Y5F1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCDHB12Q9Y5F1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCDHB12Q9Y5F1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCDHB12Q9Y5F1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCDHB12Q9Y5F1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCDHB12Q9Y5F1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PCDHB12Q9Y5F1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCDHB12Q9Y5F1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCDHB12Q9Y5F1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms