Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP15Q9Y4E8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP15Q9Y4E8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP15Q9Y4E8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP15Q9Y4E8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP15Q9Y4E8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP15Q9Y4E8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP15Q9Y4E8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP15Q9Y4E8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms